Twitterに関わらずアプリやネットなどの使い方を誤ると操作に制限をかけられる場合があります。
悪意を持って使う人もいれば無意識のうちに正しくない使い方をしていまってこういったことが起こります。
運営側は良かれと思ってそういう制限を付けている場合がありますがこういったことを知らずに使うとこのような結果になる場合があります。

相手にリプライ届かない現象は数日経つと解除されるみたいです。
ただまたこのような使い方をすると制限かけられるかもしれないので注意しましょう。